يعالج دواء نيبسين تسمم الدم، التهابات الرئة والجهاز التنفسي السفلي، التهابات شديدة في الدماغ والحبل الشوكي، العدوى في منطقة البطن، التهابات الجلد والعضلات والأنسجة المحيطة، التهابات الجهاز البولي المعقدة والمتكررة، يصنف دواء نيبسين ضمن مجموعة الأدوية المضادة للبكتيريا المعروفة بالأمينوغليكوزيدات، يعمل هذا الدواء عن طريق القضاء على البكتيريا أو تثبيط تكاثرها ومع ذلك لا يستخدم دواء
نيبسين لعلاج الأمراض الفيروسية مثل نزلات البرد أو الإنفلونزا أو أي عدوى فيروسية أخرى.