يستخدم دواء اليكسوكين للعلاج والوقاية من الاصابة بالملاريا وخاصة عند السفر الى المناطق التي ينتشر فيها هذا المرض، وكذلك لتخفيف الأعراض المرتبطة به لدى الأشخاص المصابين بالفعل، يستخدم في علاج امراض وحالات أخرى تبعا لإرشادات الطبيب المختص وتشمل هذه الحالات بعض الأمراض المناعية مثل الذئبة الحمامية والتهاب المفاصل الروماتويدي، حيث يساهم دواء
اليكسوكين في التخفيف من الالتهاب وتنظيم نشاط الجهاز المناعي.