يستخدم دواء الفاتشيموتريبسين بشكل شائع للتخفيف من الالتهابات فهو يساعد في تقليل التورم والالم الناتج عن الاصابات او الجراحة، يلعب الفاتشيموتريبسين دورا مهما في تحسين التفاعلات الهضمية ويساعد في تفكيك البروتينات الكبيرة الى وحدات اصغر من الأحماض الأمينية مما يسهم في تسهيل امتصاص العناصر الغذائية في الأمعاء، في حالات الربو او مرض انسداد الشعب الهوائية المزمن (COPD) يستخدم
الفاتشيموتريبسين للتخفيف من المخاط الزائد فهو يساعد في تفكيك المخاط السميك مما يسهل عملية التنفس، يعتبر الدواء مفيدا في بعض الحالات المتعلقة بتجلط الدم ويساعد في تقليل اللزوجة في الدم مما يمكن ان يقي من حدوث التجلطات، يتم استخدام هذا الدواء احيانا لعلاج بعض الحالات الجلدية حيث يقلل من التورم والالتهاب ويمكن تن يكون مفيدا بعد عمليات التجميل أو في حالات الحروق البسيطة.