يتم استخدام فراكسيبارين في حالات الوقاية من الجلطات الدموية لدى المرضى الذين يعانون من خطر مرتفع للاصابة بها مثل الاشخاص الذين يخضعون لعمليات جراحية كبرى لا سيما العمليات التي تطال مناطق مثل الوركين او الركبتين، كما يستخدم في علاج الجلطات الدموية القائمة مثل الجلطات الوريدية العميقة والانصمام الرئوي لوقف تفاقم المشكلة ومنع انسداد الاوعية الحيوية، يمكن وصف
فراكسيبارين في بعض الحالات الخاصة التي تستدعي استخدام مضادات التخثر المعايرة بعناية مثل النساء الحوامل اللواتي يعانين من اضطرابات قابلة للتسبب في الجلطات الدموية او المرضى المصابين بحالات مرضية كالرجفان الاذيني المزمن الذي يزيد من احتمال تكون الخثرات.